Wabenhygiene soll die Belastung mit Krankheitserregern und Rückständen begrenzen. Regelmäßiger Wabentausch verhindert eine zu starke Alterung des Materials. Auffällige Waben müssen gesondert beurteilt und gegebenenfalls ausgeschieden werden. Saubere Lagerbedingungen schützen unbebrütete und ausgebaute Waben. Maßnahmen sollten zum Gesundheitsstatus und zur Betriebsweise passen. Ein nachvollziehbarer Wachskreislauf unterstützt die Hygiene zusätzlich.